Désespéré de trouver des fonds pour financer ses recherches sur l'hypothétique intelligence des vélocirapteurs, le docteur Alan Grant (Neill), paléontologue réputé, accepte d'accompagner un richissime aventurier (Macy) et sa femme (Leoni) dans un vol de reconnaissance au-dessus de l'île Isla Sorna. La tristement célèbre île, anciennement le site B de InGen, est à la fois le foyer de reproduction des créatures préhistoriques réanimées par John Hammond, et un centre d'attraction pour tout trompe-la-mort à la recherche de sensations fortes. Suite à un tragique accident les sept membres de l'expédition se retrouvent prisonniers sur l'île et le docteur découvre la vraie raison derrière l'invitation qu'on lui avait faite. Alors que le groupe lutte pour sa survie, le docteur Grant a l'occasion de vérifier d'un peu trop près les dangereuses implications de sa théorie sur l'intelligence des rapteurs.