En 2032, la distinction entre l'homme et la machine a presque totalement disparu. Les Humains ont oublié qu'ils sont humains. Batou est un cyborg vivant. Son corps synthétique abrite ce qui lui reste d'humanité : des bribes de son cerveau et le souvenir d'une femme mystérieuse. Mais il s'accroche désespérément aux dernières traces de son humanité, dans un monde où l'âme est en train de perdre toute sa valeur.